Η λέξη προέρχεται από το ρήμα εκκαλώ (εκ + καλώ) που σήμαινε συγκαλώ. Αρχικά είχε την έννοια της συγκέντρωσης (εκκλησία του δήμου) ανθρώπων για έναν προκαθορισμένο σκοπό. Με την διάδοση του Χριστιανισμού άλλαξε σημασία αποκτώντας θρησκευτικό περιεχόμενο. Στην Καινή Διαθήκη δηλώνει το σύνολο των χριστιανών. Σήμερα τον όρο εκκλησία τον χρησιμοποιούμε για τους χριστιανικούς ναούς.